Tek seferde binden fazla örneği analiz edebilen korona testi geliştirildi

Antikorlarının tespit edilmesi için yeni bir çip (Araştırma ekibi)
Antikorlarının tespit edilmesi için yeni bir çip (Araştırma ekibi)
TT

Tek seferde binden fazla örneği analiz edebilen korona testi geliştirildi

Antikorlarının tespit edilmesi için yeni bir çip (Araştırma ekibi)
Antikorlarının tespit edilmesi için yeni bir çip (Araştırma ekibi)

Antikor testi, yeni tip koronavirüs (Kovid-19) hastalığına neden olan SARS-CoV-2 virüsünün yayılmasını izlemek için güçlü bir araç olabilir. Zira, İsviçre Federal Politeknik Okulu Biyomühendislik Enstitüsü, Cenevre Üniversitesi ve Cenevre Üniversitesi Hastaneleri’nden İsviçreli bilim adamları, tek seferde, parmaktan alınmış olan binden fazla kan örneklerini analiz edebilen güvenilir ve ucuz bir antikor testi geliştirdiler. Bu başarılarına yönelik çalışmaları Pazartesi günü PNAS dergisinde yayımlandı.
Bir kişinin SARS-CoV-2 virüsü ile enfekte olmasının ardından, vücut antikor adı verilen bağışıklık molekülleri üretmeye başlar. Kovid-19 antikor testleri, kanda SARS-CoV-2’ye karşı antikorların varlığını tespit eder.
Antikorların gelişmesi birkaç gün ila birkaç haftalık bir süre gerektirdiği için, antikor testleri aktif enfeksiyonları tespit edemezler ancak virüsün topluluklarda bulaşmış olduğu oranları tespit etmeye yardımcı olabilirler. Bu bilgi epidemiyolojik araştırmalarda ve halk sağlığı politikalarını yönlendirilmesinde faydalı olur. Antikor testleri ayrıca, Kovid-19’a karşı geliştirilen aşılarının klinik çalışmalar sırasında etkinliğini değerlendirmek için de güçlü bir araçtır. Zira bilim adamları, gönüllü kişilerin aşı olmalarının ardından antikor artışlarını takip ederler.

Hassas bir test geliştirildi
Antikor testleri oldukça pahalıdır ve genellikle damar yolundan daha büyük miktarlarda kan alınmasına ve hassas miktarda reaktif kullanılmasına dayanır ayrıca testler sadece eğitimli sağlık personeli tarafından yapılabilir. Buna ek olarak, piyasadaki bazı testler güvenilir sonuçlar vermeyecek kadar hatalıdır. İsviçre Federal Politeknik Okulu (EPFL), Cenevre Üniversitesi Hastanesi’nden araştırmacılar ise söz konusu hataların üstesinden geldi ve hassas miktarda reaktif ve tek bir damla kan kullanarak aynı anda yüzlerce örneği analiz edebilen son derece hassas bir test geliştirdiler.
Çalışmanın yazarı olan EPFL’de Biyomühendislik Enstitüsü’nden Zoe Swank, çalışmanın yayınlanması ile eş zamanlı olarak EPFL’nin web sitesinde yayınlanan raporda şunları söyledi:
“Çalışmamızın yöntemindeki en harika şey, minimum reaktifle aynı anda çok sayıda testin yapılabilmesi, hatta insanların evlerinde kendi kan örneklerini almasını sağlayabilmesidir.”
Tek seferde bin 24’e varan bir sayıda örneği analiz edebilen test çipi, USB bellek büyüklüğündeki plastik bir çipin içine oyulmuş küçük tüplerden oluşan karmaşık bir ağdan oluşuyor.
Testin gerçekleştirilmesi için, araştırmacılar bu mikroakışkan çiplerin kanallarına kan örneklerini ve test reaktiflerini aktarıyorlar, kan örneğinde SARS-CoV-2’ye karşı antikorlar varsa, moleküller bir sinyal üretir ve bu mikroskop altında floresan ışıma olarak görülebiliyor.
Ekip, SARS-CoV-2 ile enfekte olan 155 kişinin kan örneklerini test ettiğinde, vakaların yüzde 98’inde antikor tespit edildi. Test, virüs ile enfekte olmamış kişilerden alınan örneklerde virüse karşı hiçbir antikor tespit etmemesi sebebiyle son derece sınır kaldı.
Mikroakışkan cihazın çok küçük olması dikkate alındığında, kullanılan kan ve reaktif miktarları, standart Kovid-19 antikor testleri için gerekli çok küçük bir kısmını gerektiriyor.
Cenevre Üniversitesi Patoloji ve İmmünoloji Bölümü’nden çalışmanın ortak yazarı Sebastian Maerkl “Tek bir çipte yüzlerce testin gerçekleştirilmesi, kişinin daha kısa sürede daha fazla test yapılabilmesinin yanı sıra istihdama bağlı potansiyel maliyetlerden tasarruf edebileceği anlamına geliyor” dedi.
Maerkl “Maaş ve reaktif maliyetleri dahil olmak üzere her şeyi dikkate alırsanız, tek bir testin maliyeti yaklaşık 0,5 İsviçre Frangı olur” ifadelerini de sözlerine ekledi.
İnsanların damarlarından kan alma ihtiyacını ortadan kaldırmak için, Swank ve meslektaşları, parmaktan alınan kan örneklerini kullanıp kullanamayacaklarını değerlendirdiler. Bu yöntem az miktarda kan örneği alınması için parmağın küçük bir iğne ile delinmesine dayanan basit bir işlemdir.

Üç cihaz test edildi
Araştırmacılar, diyabetli kişilerin kan şeker seviyelerini ölçmek kullanılan glikoz test şeritleri de dahil olmak üzere, parmağın iğne ile delinmesiyle gerçekleştirilen kan testlerinden piyasada bulunan üç cihazı test ettiler.
Ticari olarak mevcut olan söz konusu 3 cihaz ile alınan kan örneklerinde, kurumaya bırakılmış ve oda sıcaklığında yaklaşık bir hafta tutulmuş olsa veya kan örnekleri Cenevre’de bulunan Lozan’a normal posta ile gönderilse bile antikor testi yapılabilir.
Cenevre Üniversitesi Hastaneleri Enfeksiyon Hastalıkları Bölümü’nden çalışmaya katılan araştırmacı Isabella Eckerl şunları söyledi:
“Evde bir yapılabilecek olan parmağa iğne batırılması ile kan alma yöntemi ve yüksek doğruluk oranına sahip laboratuvar tabanlı olması, bu testi büyük ölçekli epidemiyolojik çalışmalar için son derece çekici kılar. Yeterli laboratuvar kapasitesi bulunmayan uzak coğrafi bölgelerde örneğin Sahra Altı Afrika’da bile kullanılabilir.”



Stonehenge'i inşa edenlerin yerini alan göçmenlerin kökeni ortaya çıktı

Yaz gündönümü kutlamaları sırasında Stonehenge'de güneş batıyor (Reuters)
Yaz gündönümü kutlamaları sırasında Stonehenge'de güneş batıyor (Reuters)
TT

Stonehenge'i inşa edenlerin yerini alan göçmenlerin kökeni ortaya çıktı

Yaz gündönümü kutlamaları sırasında Stonehenge'de güneş batıyor (Reuters)
Yaz gündönümü kutlamaları sırasında Stonehenge'de güneş batıyor (Reuters)

Arkeologlar, Britanya'ya göç ederek Neolitik Stonehenge'i inşa edenlerin yerini 100 yıl içinde alan, çan biçimli çömlek kültürüne (Bell Beaker) sahip halkın kökenlerini ortaya çıkardı.

DNA çalışmaları, çan biçimli çömlek kültürüyle bağlantılı topluluğun Britanya'ya göç etmesinin ardından, MÖ 2400 civarında Britanya'da büyük bir demografik değişim yaşandığını göstermişti. 

İsimlerini, yaptıkları son derece özgün çömleklerden alan bu göçmenler, bu dönemde Avrupa'ya hızla yayılmıştı ancak tam olarak nereden geldikleri ve nüfuslarının nasıl şekillendiği bugüne kadar bilinmiyordu.

Araştırmacılar yeni çalışmada MÖ 8500 ila MÖ 1700'de Hollanda, Belçika ve Almanya'nın batısında yaşamış 112 bireyin DNA'sını analiz ederek çan biçimli çömlek nüfusunun kökenlerini gözler önüne serdi.

Bilim insanları Ren-Maas sulak alanlarında yaşayan, büyük ölçüde avcı-toplayıcı soyundan gelen, kendine özgü niteliklere sahip bir topluluğun, çan biçimli çömlek kültürüyle bağlantılı insanlarla karıştığını saptadı.

Hakemli dergi Nature'da yayımlanan yeni araştırmaya göre, MÖ 2500 civarında gerçekleşen bu olay sonucu ortaya çıkan nüfus daha sonra Avrupa'nın kuzeybatısına yayıldı.

Önceki araştırmalar, çan biçimli çömlek kültürünün tek bir yerden ve çoğunlukla da günümüzün İspanya ve Portekizi'ni içeren İberya'dan çıkarak her yere yayıldığını ima ediyordu.

Ancak son DNA analizleri, yerel avcı-toplayıcıların torunlarıyla Avrupa'ya yeni gelen, bozkırlarla bağlantılı atalara sahip grupların karışımı sonucu çan biçimli çömlek kültürü nüfusunun ortaya çıktığını gösteriyor.

Çoğunlukla modern Hollanda, Belçika ve Batı Almanya'yı içeren Ren-Maas'ın aşağısındaki bölgede, birden fazla atadan gelen grupların karışımından oluşmuşlar.

Araştırmacılar, bozkır göçmenlerinin de MÖ 3000 civarında bu grup karışımına katıldığını söylüyor.

Çan biçimli çömlek kültürüyle ilişkili bu gruplar Britanya'ya geldiklerinde, bölgede Stonehenge'i inşa eden mevcut Neolitik çiftçilerin yerini neredeyse tamamen aldılar; bu, arkeolojik zaman ölçeğinde çarpıcı bir değişimdi.

Bilim insanları araştırmada şöyle yazıyor:

Daha sonra bölgeye yayılmaları, Avrupa'nın kuzeybatısının çok daha geniş bir kısmında, özellikle de yerel Neolitik ataların yüzde 90-100'ünün yerine geçtikleri Büyük Britanya'da, yıkıcı bir etki yarattı.

Bilim insanları, bu dönüşümün muhtemelen veba gibi bir hastalık tarafından tetiklendiğini ve Avrupa kıtasındaki insanlar bu hastalığa karşı bağışıklık gösterirken, Britanya'dakilerin gösterememiş olabileceğini düşünüyor.

Ancak çan biçimli çömlek kültürüyle ilişkili topluluklar yayıldıkça, bu yapıları inşa eden gruplar gitmiş olsa da Stonehenge ve Avebury gibi mevcut anıtları kullanmaya başladılar.

Çan biçimli çömlek kültürüyle bağlantılı topluluk metal işçiliği, okçuluk ve kendilerine özgü çömlek tarzlarını da Britanya'ya götürdü.

Huddersfield Üniversitesi'nden çalışmanın yazarı Maria Pala, "Antik DNA çalışmaları genellikle geçmişimizin beklenmedik sayfalarını gün ışığına çıkarır... Bu tür bulguların bizi hâlâ şaşırtabilmesi, antik DNA çalışmalarının gücünü kanıtlıyor" diyor.

Independent Türkçe


Antik Roma'nın kayıp oyunu yapay zekayla ortaya çıkarıldı

Bilim insanları 1500 yıllık taş levhanın oyun tahtası olduğunu söylüyor (Antiquity)
Bilim insanları 1500 yıllık taş levhanın oyun tahtası olduğunu söylüyor (Antiquity)
TT

Antik Roma'nın kayıp oyunu yapay zekayla ortaya çıkarıldı

Bilim insanları 1500 yıllık taş levhanın oyun tahtası olduğunu söylüyor (Antiquity)
Bilim insanları 1500 yıllık taş levhanın oyun tahtası olduğunu söylüyor (Antiquity)

Bilim insanları Antik Roma'dan kalma bir oyunun kurallarını yapay zeka yardımıyla çözdü. 

Hollanda'nın Heerlen kentindeki bir arkeolojik kazı alanında keşfedilen beyaz kireçtaşı levhanın ne amaçla kullanıldığı yıllardır merak konusuydu.

Bölge, İmparator Augustus'un (MÖ 27-MS 14) hükümdarlığı döneminde kurulan ve Batı Roma İmparatorluğu'nun MS 476'da yıkılmasına kadar varlığını sürdüren Coriovallum kasabasına ev sahipliği yapıyordu. Arkeologlar bu nedenle levhanın yaklaşık 1500 yıllık olduğunu tahmin ediyor.

Bazı uzmanlar kireçtaşı parçasının dekorasyon veya kaldırım taşı olarak kullanıldığını düşünürken, yeni çalışma daha keyifli bir işleve işaret ediyor.

Leiden Üniversitesi'nden Walter Crist ve ekibi, üç boyutlu görüntüleme tekniğinden yararlanarak levhaya oyulmuş çapraz ve düz çizgilerin bazılarının diğerlerinden daha derin olduğunu saptadı.

Araştırmacılar tahta üzerinde hareket ettirilen taşların buna yol açtığını düşünüyor.

Ekip daha sonra yapay zeka sistemi Ludii'ye binlerce olası kural setini test ettirerek levhadaki izlere en uygun versiyonu anlamaya çalıştı.

Ludii, iki sanal oyuncuyu karşı karşıya getirdiği binlerce senaryoda daha sonraki oyunlara dair bilgisinden yararlandı.

Crist, "Birçok farklı kombinasyon denedik: üç parçaya karşı iki parça, dört parçaya karşı iki parça veya iki parçaya karşı iki parça... Tahtadaki aşınmayı hangisinin ortaya çıkardığını test etmek istedik" diye açıklıyor.

Bulguları hakemli dergi Antiquity'te dün (11 Şubat) yayımlanan çalışmaya göre biri iki, diğeri 4 taşa sahip iki oyuncu taşlarını tahta üzerinde hareket ettirerek karşı tarafın hareketini sınırlamaya çalışıyor ve bunu ilk başaran oyunu kazanıyordu.

Ludus Coriovalli (Coriovallum Oyunu) adlı oyun internetten oynanabiliyor.

Bilim insanları bu tür engelleme oyunlarına Avrupa'da Ortaçağ'a kadar rastlanmadığını söylüyor. Go ve Domino bu tür oyunların bugün bilinen örnekleri arasında sayılabilir; ancak Ludus Coriovalli doğrudan bunlara benzemiyor.

Öte yandan oyunun Antik Roma'da gerçekten bu şekilde oynandığı da kesin bir şekilde söylenemiyor.

Çalışmanın yazarlarından Dennis Soemers şu ifadeleri kullanıyor: 

Ludii'ye bu levha üzerindeki gibi bir çizgi deseni sunulunca, her zaman oyun kurallarını bulacaktır. Bu nedenle Romalıların bunu tam olarak bu şekilde oynadığından emin olamayız.

Yine de yeni çalışma özellikle yapay zekayı kullanma biçimiyle önemli bir adıma işaret ediyor. Araştırmacılar bu yöntemin başka alanlarda da uygulanabileceğini düşünüyor.

Crist, "Yapay zekayla simüle edilen oyunun, bir kutu oyununu tanımlamak için arkeolojik yöntemlerle birlikte kullanıldığı ilk örnek bu" diyerek ekliyor: 

Bu araştırma, eski kültürlerden kalma alışılmadık oyunları tanımlamak için gereken araçları sunuyor. Çünkü mevcut tanımlama yöntemlerinde oyun yüzeyini oluşturan geometrik desenler, metinlerdeki referanslara veya sanatsal temsillerine dayanarak günümüzde bilinen oyunlarla ilişkilendiriliyor.

Independent Türkçe, Science Alert, IFLScience, Science News, Antiquity


Amerika'nın eski uygarlığı, yükselişini kuş dışkısına borçluymuş

Chincha Krallığı, deniz kuşlarının dışkısını kullanarak daha çok ürün elde etmeyi başarmış (Unsplash)
Chincha Krallığı, deniz kuşlarının dışkısını kullanarak daha çok ürün elde etmeyi başarmış (Unsplash)
TT

Amerika'nın eski uygarlığı, yükselişini kuş dışkısına borçluymuş

Chincha Krallığı, deniz kuşlarının dışkısını kullanarak daha çok ürün elde etmeyi başarmış (Unsplash)
Chincha Krallığı, deniz kuşlarının dışkısını kullanarak daha çok ürün elde etmeyi başarmış (Unsplash)

Amerika kıtasındaki eski uygarlıklardan birinin, kuş dışkısı sayesinde güç kazandığı ortaya çıktı.

Bugünkü Peru'nun güneyinde MS 900 civarında kurulduğu düşünülen Chincha Krallığı, 1480'de İnka İmparatorluğu'nun hakimiyetine girmişti.

Chincha bu tarihten önce İnkalarla mısır ticareti yaparak "chicha" adlı içkilerini ürettikleri hammaddeyi sağlıyordu.

Sidney Üniversitesi'nden Dr. Jacob Bongers ve ekibinin yeni çalışmasına göre Chincha halkı, ekonomilerini büyütmelerini sağlayan mısırı deniz kuşlarının dışkısı veya "guano" sayesinde yetiştiriyordu.

Bilim insanları, Chincha uygarlığı döneminde 100 bin kişinin yaşadığı düşünülen Chincha Vadisi'ndeki mezarlarda bulunan 35 mısır koçanı kalıntısını analiz etti.

Bulguları hakemli dergi PLOS One'da dün (11 Şubat) yayımlanan çalışmaya göre mısırlar son derece yüksek seviyede azot içeriyordu.

Deniz kuşlarının beslenme biçimi, dışkılarını azot bakımından zengin kılıyor; bu da Chincha'nın toprağı guanoyla verimlendirdiğine işaret ediyor.

Seramik, çömlek, duvar oymaları ve resimleri de inceleyen ekip,  deniz kuşlarıyla mısırın yan yana betimlendiğini ve Chincha toplumunda kültürel önem taşıdığını belirtiyor.

Kuş dışkısı, Chincha Krallığı'nın daha fazla mısır üretip ekonomilerini büyütmelerini, nüfuslarını artırmalarını ve Güney Amerika'da İnka öncesi refah düzeyi en yüksek toplumlardan biri haline gelmelerini sağlamıştı.

Dr. Bongers, "Deniz kuşu gübresi önemsiz görünebilir ancak çalışmamız bu güçlü kaynağın, And Dağları'nın Peru bölgesindeki sosyopolitik ve ekonomik değişimine önemli katkı sağladığına işaret ediyor" diyerek ekliyor: 

Eski And kültürlerinde gübre, güç demekti.

Araştırmacılar halkın kuş dışkılarını yakınlardaki Chincha Adaları'ndan topladığını tahmin ediyor.

Teksas A&M Üniversitesi'nden Dr. Jo Osborn, Chincha halkının bu kaynağa ulaşmasının ötesinde ekolojik bilgisinin, çalışmanın en ilginç kısmı olduğunu düşünüyor.

Makalenin ortak yazarı Dr. Osborn "Sahip oldukları geleneksel bilgi, deniz ve kara yaşamı arasındaki bağlantıyı görmelerini sağladı ve bu bilgiyi, krallıklarını kuran tarımsal üretim fazlasına dönüştürdüler" ifadelerini kullanıyor:

Sanatları bu bağlantıyı kutluyor ve bize güçlerinin sadece altın veya gümüşten değil, ekolojik bilgelikten kaynaklandığını gösteriyor.

Independent Türkçe, BBC Science Focus, Popular Science, PLOS One